《关于创新体制机制推进农业绿色发展的意见》提出，“建立贫困地区农业绿色开发机制”。贫困地区大多处于江河上游、湖库水系源头、农牧交错地带，生态地位极为重要，生态系统又十分脆弱。建立农业绿色开发机制，就是要统筹推进产业发展和生态保护，将贫困地区生态环境优势转化为产业优势、经济优势、后发优势。这既是当前治贫之举，也是长远固本之策，事关脱贫和发展的可持续性，事关国家生态安全。
坚持保护优先，为子孙后代预留发展空间。牢固树立大局观、长远观、整体观，把生态保护放在优先位置，摸清资源底数，立足环境承载力，科学编制农业产业发展规划，精准选择特色优势农业，合理确定产业开发强度。要划定生态保护红线，彻底改变大开发、拼产值、比税收的功利主义、形式主义倾向，坚决不选破坏资源和环境的产业，坚决不走先污染后治理的老路，坚决不干毁祖传家业、断子孙后路的蠢事，让农业产业发展经得住实践、人民和历史的检验。
做足山水文章，让绿水青山成为脱贫靠山。牢固树立绿水青山就是金山银山的理念，用好生态绿色牌、善做山水文章，推行绿色生产方式，推进绿色产业扶贫，向绿色要生产力、竞争力，走出一条生态文明建设与经济发展相得益彰的脱贫致富道路。发挥贫困地区比较优势，发展绿色产业、生态产业、循环产业，发展休闲农业和乡村旅游，推进一二三产业融合发展，让贫困群众从农业产业发展中得到更多实惠。
强化品牌打造，给扶贫产业插上腾飞翅膀。抓住农业供给侧结构性改革的有利机遇，适应消费市场升级需求，在贫困地区大力发展绿色、有机和地理标识优质绿色农产品。支持贫困地区打造区域公用品牌，做好品牌培育、推介、引导和监督，扩大品牌影响力，提升特色优势产业的核心竞争力。指导支持贫困地区创建一批特色优势明显、产业基础好、发展潜力大、带动能力强的国家级特色农产品优势区，打造一批特色农业品牌，带动农民群众脱贫致富。
创新体制机制，为绿色发展提供有力保障。优化贫困地区农业主体功能与空间布局，以粮食生产功能区、重要农产品生产保护区划定以及特色农产品优势区创建为抓手，建立反映市场供求与资源稀缺程度的农业生产力布局制度。以县为单位，建立农业产业准入负责清单制度，明确种养业发展方向和开发强度。强化资源保护与节约利用，建立健全耕地轮作休耕制度、节约高效的农业用水制度以及农业生物资源保护与利用体系。加强生态环境保护，建立健全农业投入品减量使用、畜禽粪污资源化利用、草原保护等方面的制度。