内设机构：
办公室、人事科、法规与综合行政执法监督科（行政审批科）、政策与改革科、发展规划科、计划财务科（内审科）、种植业管理科、植保土肥农药管理科、畜牧兽医科、渔业渔政管理科、乡村产业发展科（农产品加工指导科）、乡村建设科、农村社会事业促进科（县域经济发展科）、农村合作经济指导科、帮扶科、区域协作促进科、监督检查科（乡村振兴工作办公室）、市场信息与对外交流合作科、科技教育与种业管理科（农业转基因生物安全管理办公室）、农业资源保护与利用科、农产品质量安全监管科、农业机械化管理科、农田建设与农垦科、机关党委（纪委）、离退休人员管理服务科。
主要职责：
（一）统筹研究和组织实施以乡村振兴为重点的“三农”工作中长期规划、重大政策。
（二）负责市本级农业违法案件和市辖区违法案件的查处，指导、监督各县市、屈原管理区农业综合行政执法工作。
（三）统筹推动发展农村社会事业、农村公共服务、农村文化、农村基础设施和乡村治理。
（四）负责农民承包地、农村宅基地、农村集体产权制度改革和管理有关工作。
（五）负责巩固拓展脱贫攻坚成果有关工作。
（六）牵头协调推进县域经济发展。
（七）负责种植业、畜牧业、渔业、农垦、农业机械化等农业各产业的监督管理。
（八）负责农产品质量安全监督管理。
（九）负责耕地、永久基本农田质量保护和高标准农田建设工作。
（十）负责有关农业生产资料和农业投入品的监督管理。
（十一）负责农业防灾减灾、农作物重大病虫害防治工作。
（十二）负责农业投资管理。
（十三）推动农业农村科技体制改革和科技创新体系建设。
（十四）指导农业农村人才工作。
（十五）牵头开展农业对外合作工作。
（十六）完成市委、市政府交办的其他任务。